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Transwell小室底層有一張通透性的膜（一般為聚碳酸酯膜），將其放置于孔板中，小室內稱上室，培養板內稱下室。由于聚碳酸酯膜有通透性，下層培養液中的成分可以影響到上室內的細胞。應用Transwell可研究下層培養液中的成分對上室細胞生長、運動等的影響。

1.細胞共培養：

1)下室中接種能夠分泌細胞因子或特定蛋白產物的細胞，在上室中接種效應細胞；

2) 按照實驗設計培養一定時間；

3) 檢測效應細胞的活力改變，亦可使用流式細胞儀檢測細胞凋亡率，WB檢測細胞表面分子及凋亡相關分子的表達。

2.趨化實驗：

1) 在上室中接種相應細胞，下室中接種能分泌細胞因子的細胞或加入特定細胞因子的培養基；

2)計數進入下室的細胞，以反應分泌產物或特定因子對細胞的趨化作用。

3.腫瘤細胞遷移實驗

1)在上室接種效應細胞，下室中加入待測樣品（化合物、提取物或混合物等）；

2)計數進入下室的細胞量，可評價待測樣品對腫瘤細胞遷移的影響。