2023年3月，深圳市第三人民醫(yī)院（南方科技大學(xué)第二附屬醫(yī)院）／深圳國(guó)家感染性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心盧洪洲教授團(tuán)隊(duì)，在THE LANCET Microbe發(fā)表題為Viral and antibody dynamics of acute infection with SARS-CoV-2 omicron variant (B.1.1.529): a prospective cohort study from Shenzhen, China的研究論文。
【背景】
闡明SARS-CoV-2在感染宿主體內(nèi)（特別是在傳播能力迅速增加的感染初期）的復(fù)制動(dòng)力學(xué)，對(duì)于制定有效的、針對(duì)性的公共衛(wèi)生措施至關(guān)重要。因此，本研究分析了與發(fā)病天數(shù)以及實(shí)驗(yàn)確診天數(shù)相關(guān)的病毒和抗體動(dòng)力學(xué)，以及SARS-CoV-2在整個(gè)感染過(guò)程的復(fù)制動(dòng)力學(xué)。
【方法】
在這項(xiàng)前瞻性隊(duì)列研究中，我們對(duì)2020年1月11日至2022年4月24日期間在深圳市第三人民醫(yī)院（中國(guó)深圳）住院的SARS-CoV-2確診感染患者進(jìn)行了篩選，納入了免疫功能正常、未使用SARS-CoV-2靶向抗病毒藥物治療的急性期感染患者。通過(guò)對(duì)應(yīng)采集鼻咽拭子和血漿樣本，檢測(cè)SARS-CoV-2病毒RNA和特異性IgG抗體并得到數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)使用Local Polynomial Regression方法對(duì)病毒和抗體動(dòng)力學(xué)進(jìn)行分析，使用Mann-Whitney U檢驗(yàn)和Gehan-Breslow-Wilcoxon方法分析病毒和抗體動(dòng)力學(xué)與疫苗接種、年齡、性別、疾病嚴(yán)重程度和基礎(chǔ)健康狀況之間的關(guān)聯(lián)。
【結(jié)果】
1. Omicron 變異株與癥狀相關(guān)的病毒動(dòng)力學(xué)：本研究納入并分析了采集自2,043例SARS-CoV-2急性期感染者（原型株[A.1]）和D614G突變株[B.1]，N=217；Delta突變株[B.1.617.2]，N=105；Omicron突變株[B.1.1.529]，N=1721）的15406個(gè)鼻咽拭子樣本和2324個(gè)血漿樣本檢測(cè)結(jié)果。Omicron突變株感染患者在發(fā)病第一天（無(wú)癥狀感染者確診當(dāng)天定義為發(fā)病第1天）的平均Ct值為22.65（95%置信區(qū)間：22.05~23.26），平均需要3.19天（95%置信區(qū)間：3.09~3.28）達(dá)到峰值病毒載量（平均Ct值17.63，95%置信區(qū)間：17.47~17.79），平均需要13.50天（95%置信區(qū)間：13.32~13.67）達(dá)到病毒清除病毒標(biāo)準(zhǔn)（Ct值≥35）。其中Omicron 變異株在沒(méi)有潛在健康狀況者與有潛在健康狀況的參與者相比，沒(méi)有潛在健康狀況者在病毒載量達(dá)到峰值后比那些有潛在健康狀況的參與者更快地被清除。
2. 野生型 SARS-CoV-2 delta和 Omicron變異的病毒動(dòng)態(tài)比較：與野生型毒株和Delta突變株相比，Omicron突變株復(fù)制更快、病毒清除時(shí)間更短，其發(fā)病第1天和峰值病毒載量均低于Delta突變株，但均高于野生型毒株。
3. Omicron變異株在整個(gè)感染過(guò)程中的復(fù)制動(dòng)力學(xué)：為了闡明 Omicron 變異在宿主感染過(guò)程中的病毒動(dòng)力學(xué)，本研究選擇了實(shí)驗(yàn)室確認(rèn)時(shí) Ct 值大于 35的參與者，以及實(shí)驗(yàn)室確認(rèn)時(shí) Ct 值與病毒峰值負(fù)荷之間的差異大于 9·99(約增加 1000 倍)的參與者進(jìn)行進(jìn)一步分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，年齡、性別、疾病嚴(yán)重程度和基礎(chǔ)疾病與Omicron突變株的病毒動(dòng)力學(xué)相關(guān)，在兒童（0~14歲）、男性、無(wú)癥狀和無(wú)基礎(chǔ)疾病的患者中病毒清除速度更快。整個(gè)感染過(guò)程的病毒動(dòng)力學(xué)分析結(jié)果顯示，Omicron突變株感染后平均需要5.06天（95%置信區(qū)間：4.76~5.36）達(dá)到峰值病毒載量，平均14.27天（95%置信區(qū)間：13.6~14.93）達(dá)到病毒清除標(biāo)準(zhǔn)。
4. Omicron變種急性感染期的抗體動(dòng)態(tài)：通過(guò)對(duì) 1553 名 Omicron 變異感染患者的 2324 份血漿樣本進(jìn)行了 SARS-CoV-2 特異性 IgG 抗體檢測(cè)，并對(duì)確認(rèn)感染后 28 日內(nèi)的2261份樣本進(jìn)行了分析。抗體動(dòng)力學(xué)分析結(jié)果顯示，與未接種疫苗的感染者相比，即使最后一針疫苗的接種時(shí)間與感染時(shí)間的間隔超過(guò)7個(gè)月，Omicron突變株突破感染者體內(nèi)SARS-CoV-2特異性抗體產(chǎn)生的更早、更快，達(dá)到的峰值更高。
【結(jié)論】
本研究全面解析了SARS-CoV-2 Omicron突變株急性感染期的病毒和抗體動(dòng)力學(xué)特征，研究結(jié)果對(duì)制定人群篩查、抗病毒治療、隔離期和疫苗接種等公共衛(wèi)生策略具有重要意義。
17312606166