17日，記者從浙江省農(nóng)科院獲悉，該院水生生物研究所小黃魚科研團(tuán)隊(duì)與美國奧本大學(xué)、廈門大學(xué)合作，首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細(xì)圖譜繪制，為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段，相關(guān)研究論文近日在線發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《分子生態(tài)學(xué)資源》上。
小黃魚是中國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟(jì)魚，味道鮮美，廣受青睞。2021年，浙江省農(nóng)科院等單位通過連續(xù)8年產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合攻關(guān)，突破了野生小黃魚馴活、人工催產(chǎn)和全人工規(guī)模化繁育關(guān)鍵技術(shù)，實(shí)現(xiàn)小黃魚網(wǎng)箱養(yǎng)殖規(guī)模化生產(chǎn)。隨著小黃魚全養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的擴(kuò)大和科研的深入，破譯小黃魚基因組，發(fā)掘生長、性別決定等相關(guān)重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題。
“黃魚屬擁有東海四大海產(chǎn)中的小黃魚與大黃魚兩個(gè)重要經(jīng)濟(jì)魚類，雖然它們形態(tài)和染色體核型相似，但是黃魚屬物種之間的遺傳關(guān)系尚未明確。”論文第一作者、浙江省農(nóng)科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹，本研究通過結(jié)合四類基因組測序技術(shù)，構(gòu)建了小黃魚染色體水平的基因組精細(xì)圖譜；揭示小黃魚基因組大小為706 Mb，注釋基因?yàn)?5233個(gè)；進(jìn)化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關(guān)系最近，大概在2540萬年前開始分化。
謝慶平介紹，魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向，在學(xué)術(shù)界仍然是一個(gè)有待解決的有趣謎團(tuán)。此次研究通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)、比較基因組學(xué)以及分子生物學(xué)的技術(shù)方法，鑒定出dmrt1基因?yàn)樾↑S魚的雄性特異性基因，且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現(xiàn)象產(chǎn)生的生物標(biāo)記。
論文通訊作者、浙江省農(nóng)科院水生所所長樓寶研究員表示，小黃魚全基因組的解譯和基因組精細(xì)圖譜的繪制，對于海洋漁業(yè)資源保護(hù)、小黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術(shù)的研究意義重大，可以為科研人員開展小黃魚種質(zhì)資源挖掘保護(hù)、經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎(chǔ)的輔助育種平臺(tái)。
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