2018年4月12日下午兩點，中國科學院數學與系統(tǒng)科學研究院應用數學所王勇教授來我所進行題為《解讀基因組的基因調控網絡建模》的學術報告。
王勇教授來自中國科學院數學與系統(tǒng)科學研究院應用數學所, 是國家優(yōu)秀青年基金獲得者。1999 年獲內蒙古大學數學系的數學物理專業(yè)學士學位，2002 年畢業(yè)于大連理工大學應用數學系獲運籌學與控制論碩士學位，2005年畢業(yè)于中國科學院數學與系統(tǒng)科學研究院獲得運籌學與控制論專業(yè)的理學博士學位。曾先后到美國波士頓大學生物信息學中心，日本產業(yè)技術綜合研究所計算生物研究中心和美國斯坦福大學統(tǒng)計系從事訪問研究。他目前的研究方向是生物醫(yī)學大數據建模。
報告指出：隨著測序技術的發(fā)展，可以期待在不久的將來，很多人都會有自身的全基因組測序數據，那么如何解讀人與人之間的幾百萬個基因組上特定位置的變異，特別是解釋復雜性狀和疾病相關的遺傳變異（包括單核苷酸多態(tài)（SNP）和結構變異），將是一個有著非常重要意義卻又異常有挑戰(zhàn)性的問題。該問題的挑戰(zhàn)聚焦于對位于98%的非編碼調控區(qū)域的變異的注釋，即研究這些非編碼區(qū)域的位點機理層面怎么跟表型產生聯(lián)系。其中一個根本困難是基因調控的組織、條件特異性。即在特定的條件下，特定基因表達的啟動或停止，增強或抑制，是細胞選擇基因組中的調控元件和相互作用完成基本生命活動以及對外界刺激作出應答的分子基礎。對其建模需要引入染色質調控因子以及順式調控元件的開放狀態(tài)等因素，回答轉錄因子等反式調控因子和增強因子等順式調控元件在特定的細胞環(huán)境下怎么合作實現基因的時空特異表達這些挑戰(zhàn)性問題。
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